Если у вас уже все данные в постгресе, то я не вижу смысла использовать Mongo для задач GIS. Круче PostGIS-а сейчас ничего бесплатного нет. По скорости вряд ли будут какие-то различия, индексы, по идее, обе системы использую аналогичные, с одинаковым Big O. Наоборот, выиграете из-за отсутствия необходимости туда-сюда гонять данные.