Помимо невозможности зайти под root, может быть также заблокирована возможность входа по паролю в принципе. На VPS не редко сразу предлагают создать ssh-ключ и использовать для входа именно его.
P. S. И да, выше верно написали, что вы спалили слишком много всего. Не нужно так делать.