Если вы пушили все в мастер, то PR не нужен. Если же вам нужно объеденить некую ветку с мастером, то переключаетесь на мастер и мержите в него нужную ветку - git merge branch_name
Если вы хотите отправить PR в чужой репозиторий, вам сначала нужно его форкнуть и склонировать себе локально, создать ветку, сделать изменения и запушить эту ветку, далее можете в интерфейсе гитхаба создать запрос на PR.
