Посмотрите на WWW SQL Designer
Сам иногда использую для простых схем. Вполне удобно. Скрипт можно развернуть у себя. Правда нет никаких аккаунтов на сервере, но позволяет сохранять в Local Storage.
Всем спасибо, оказалось действительно проблема в FastCGI. Настроил mod_php и всё заработало. Просто все остальные хосты на этом сервере через FastCGI крутятся и не думал, что с ним могут быть траблы.