Рецепт для битрикса.
В игнор:
/bitrix
/upload
Шаблоны и компоненты выносите в папку
/local.
Верстку для шаблона располагаете в его папке, игнорите все что собираете.
В том числе игнорите обязательный
styles.css, в который собираете стили.
Выглядеть будет вот так:
