Алексей Малинин

"Паттерны проектирования" банды четырёх. Там и примеры реализаций есть(правда не на JS).
Если проблемы с прототипным наследованием: https://github.com/lukehoban/es6features#classes. Можно скомпилировать какой-нибудь такой "класс" через babeljs и посмотреть, во что это превратится. (Это можно проделать и с TypeScript или CoffeeScript)

Мне кажется, что на чистом PHP(Ruby, Python, ...) уже очень давно не пишут. Порекомендовал бы освоить какой-нибудь фреймворк(а лучше несколько): Yii, Laravel, [любой другой фреймворк].
На 2-х собеседованиях спрашивали, знаю ли я Yii или Laravel. Ещё на многих спрашивали о Drupal, Wordpress[для меня это был однозначный признак того, что тут скучно].

Придумайте себе задачки, может даже которые уже решены. Например:
* Для CSS можно попробовать реализовать grid как в bootstrap. Инпуты в стиле Material Design(без гугления явных решений).
* Для JavaScript написать простенький браузерный редактор с поддержкой нескольких курсоров(без библиотек, конечно).