ini_get - это функция, которая получает настройки php, в вышеперечисленных файлах эта функция получает значение директивы file_uploads = Off. Поэтому и возникает ошибка. Её можно или в php.ini задать или в настройках apache, в секции VirtualServer, или в .htaccess или где-то в php-скрипте через функцию ini_set('file_uploads', '0').
дело в том, что у вас в скрипте вот эта функция ini_get('file_uploads') возвращает 0, которая возвращает настройку строки конфигурации file_uploads. Ваша задача - разобраться почему это так. Можете конечно попробовать завершить успешно конфигурацию, закомментировав эти проверки в файлах cli_install.php и step_2.php, но это - моветон. Надо найти проблему.
Александр Аксентьев: Node.JS - это среда в которой можно организовать сервер. Если делать по уму, то конечно надо делать Defferd на Q и строить асинхронную очередь.