не можно сменить
Бр...
Если есть доступ по SSH - симлинк на папку web и все. Не нужно плодить никаких кастылей.
rm public_html && ln -s application/web public_html
Если и симлинки нельзя (хотя это дико грустно), то просто перенесите точку входа на директорию выше. Кастыли с реврайтами - не очень хорошо.
