Самый разумный вариант в плане дальнейшей поддержки - форкнуть библиотеку и добавить в зависимости свой форк. Если это хотфикс какого-то бага, то можно и в основную репу его отправить и потом переключиться на нее обратно, когда его примут.
Еще один (костыльный) вариант - скопировать нужный класс в отдельную папку, изменить его поведение, а потом написать скрипт, который после
composer update и
composer install будет заменять измененным файлом файл из библиотеки. Для этого можно использовать
хуки (Спасибо
D' Normalization за ссылку).
