Стоило бы указать какой именно raid и ОС, но…
Если речь о raid 1 Скорее всего в raid-е были только эти 2 диска, которые вы отключили-подключили. Внутренний был запасным и вообще не синхронизировался. Точно можно узнать по команде cat /proc/mdstat. Там значения имеет порядковый номер — чем он меньше, тем «главнее» диск.
При выдирании-добавлении без синхронизации никак, ведь данные на одной диске стали уже не актуальны. Только лишь в том случае, если диск не был примонтирован (либо ro)
По идее, если вы построите массив из 2 дисков, второй выдерните, что-то запишите на первый, а потом второй добавите — raid должен начать синхронизацию сам, хотя я не уверен. У вас этого не произошло, так как внутренний диск видимо вообще ни в чем не участвовал (как я написал выше).
