К ошибкам приводит повышенная нагрузка к сайту из-за большого числа запросов. Либо это слабая конфигурация хостинга под базу данных, либо слишком быстро поисковые роботы выкачивают сайт. Насколько помню, у яндекса есть настройки, как быстро парсить сайт.