В общем я нашел решение!
Проблема эта в новых макбуках, там диск автоматически стоит в формате APFS. Когда идет переустановка Mac OS, он хочет опять поставить режим APFS но выдает ошибку (как я выше описал).
Суть в том что надо отформатировать диск в формат Mac OS Extended (Journal), что бы при установке Mac OS High Sierra он его опять переделал в APFS.
Для этого нужно:
1. Перезагрузить Mac в режим востноавление через интернет (Internet Recover program) - Command, Option R
2. Открыть там дисковую утилиту, сверху слева будет кнопка "Просмотреть", там выбрать "Показать все устройства". Вам будет виден сам диск и контейнер в нем.
3. Переформатировать контейнер (именно его) в Mac OS Extended (Journal).
4. Выйти из Дисковой утилиты и просто начинать устанавливать Mac Os.
done.
Простой