Да
VPN в opera скорее не является таковым, считайте это прокси, к примеру будет ли опера расшифровывать пользовательский трафик проходящий через их сервера - вопрос открыт.
И да, в вашей конфигурации опера будет выходить в интернет через системный vpn, таким образом не будет никакого способа для веб сервисов выявить ваш ip адрес (например через webrtc при отсутствии системного vpn ваш ip адрес можно получить, если сервис поднимет фиктивный клиент и подключится к вам по webrtc, даже если используется vpn от opera)