В bootstrap.css почти 7 тысяч строк...
Притом, что только для сетки обычно хватает несколько десятков строк.
Остальной код в бутстрапе - "запасной", стили для таблиц, списков, кнопок и прочее, прочее из того, что в индивидуальном дизайне редко бывает идентично бутстраповскому. А значит нужно будет удалять/переписывать кучу кода... либо оставить как есть, пусть грузится - у всех же сейчас безлимитные скоростные каналы... (правильно, это сарказм)
Поддерживать какой-либо (кстати, тоже вопрос - какой? не один бутстрап существует же) фреймворк легче только тому, кто этот фреймворк знает, тогда как грамотно написанный, аккуратный код легко поддерживать и тем кто его знает и тем кто им не владеет.
Заказчик, понятное дело, хочет как лучше, но он сам разработчик? Почему он считает, что - извините за тавтологию - лучше знает, как лучше?
Ко врачу он приходит и тоже говорит ему, как его лучше лечить?
Заказчик нанимает разработчика и вправе требовать от него качественный, поддерживаемый код. Но каким способом разработчик этого добьется - решает он сам, исходя из поставленной задачи. Да, код в бутстрапе достаточно качественный, но если 2/3 этого кода переписать, напихать кучу костылей, толку от того, что это фреймворк будет мало.