WildZero

безусловно будет интересно

Повесит функцию на onChange которая будет заполнять hidden input с фалагом изменялся/нет?

Первое что пришло на ум: таблица. Количество столбцов — максимальная ширина дерева (как раз те самые горизонтальные «отростки» в виде сестер, братьев), количество строк — максимальная высота дерева (мамы, папы, бабушки, дедушки). Как то так.