Вопрос снимается.
Вытащил из бэкапа годичной давности ту-же самую библиотеку (libftd2xx.so), положил куда надо и всё заработало. Сверил файлы - библиотеки имеют одну и ту же версию (судя по имени), но размер разный.
Вывод - эти азиаты что-то напортачили с файлами у себя на сайте, поэтому скачанная год назад на Arch библиотека работает, а скачанная сейчас на свежий Debian - уже нет.
