Ну для начала нужно решить, нет ли возможности оставить две программы отдельно, связав их через стандартный ввод/вывод, файлы или сокеты? Пусть одна запускает другую просто как дочерний процесс, это проще всего.
Если это категорически должна быть одна программа, то нужно решить, кто будет "главным".
Если главным будет Питон, который должен вызывать код на C/C++ (оформленный в виде DLL), то может пригодиться модель ctypes. Альтернативно, можно
написать модуль интерпретатора.
Если главным будет C++, который должен выполнять код на питоне, то тут уже нужно читать про
embedding python.
