Sql query, simple table, big data why long duration?

приведите ваш запрос полностью, непонятно что вы собираетесь с ним делать

Как в sublime text3 сделать чтобы любой файл по умолчанию считался html?

https://packagecontrol.io/packages/ApplySyntax

Почему count возвращает постоянно 1?

считает агрегатную функцию, в данном случае - количество, по набору уникальных значений указанного поля.
просто игнорирует, исключает дубли значений

Почему count возвращает постоянно 1?

считать кол-во уникальных значений поля лучше таким запросом:

select count( distinct id) as aggregate from "products"

Какие СУБД подходят для выборок записей, которые зависят друг от друга?

приведите пример вашего запроса, который обрабатывается неограниченно долго, и опишите немного предметную область из которой обрабатываете данные.
хорошо сформулированная задача содержит в себе половину решения