По своему опыту (а мы на работе используем мессенджер VIPole) корпоративный сервер ставят для передачи и хранения данных в мессенджере. Тогда вся инфо которой вы обмениваетесь между пользователями остается на вашем сервере, т.е. безопасность данных и процессы корпоративного общения вы контролируйте сами никуда данные не отдавая на сторону. Но понятно, что установка сервера стоит денег, за безопасность надо платить