Конечно, не присваиваются. $classes[$i] для $i > 4 у вас не определены. Ессно, что класс будет пустым.
Не думали пойти другим путем, без заморотов с присвоением класса каждому посту? Например, используя псевдокласс :nth-child и через него реализовать особенности верстки. Тогда вывод постов можете делать без всякого гимора, обычным порядком.
