Нашел такой вариант: в farmanager кодировку менять не нужно. Открыл файл db.json c помощью Pycharm,
- в нижнем правом углу программы указана кодировка UTF-16LE
- кликаем на нее и в открывшемся списке выбираем UTF-8
- во всплывающем окне выбираем Convert. ( Я не совсем понял в чем отличие Reload от Convert)