Здравствуйте.
Все сложности именно в настройке ОС а не в выборе железа :)
Думаю 1С сервер на Linux будет проблематично установить.
А что касается использования Linux, то это лучший по моему мнению вариант для сервера, но все зависит от целей.
Добавлю мануал который когда-то нашел:
www.opennet.ru/base/sys/1c_debian.txt.html 