Так настройте его. Там buttonbar настраивается без проблем, меню тоже.
Вообще люди, которым часто нужно работать с большим количеством папок и файлов, и которые хотят делать это эффективно, обычно в итоге переходят на двухпанельный файловые менеджеры типа total commander, multicommander, double commander и т.п.
вот эту часть предложения совсем не усвоил, перечитал дважды попытался понять, что значит прозрачен, насколько прозрачен, и зачем?