Разобрался сам, дело оказалось в "long" то есть мне нужно было указать переменную в этом "формате"
Так как у меня время в нем

void loop()                                        // ПРОГРАММЫй безусловный ЦИКЛ
{
  long utime = myTime.unixtime();                  //сохраняем время в формате UNIX

То есть верный код такой:

int long DurationCh_2 = 120;                  //ДЛИТЕЛЬНОСТЬ срабатывания реле
int long StartViaCh_2 = 200;                  //Включится через 
int Xer = 0;
int long StartRelCn_2;

Тогда идёт корректное сравнение и присваивание переменных