Temikus

Я использую такие силиконовые шкурки для хранения дисков. Они замечательно складываются друг на друга и защищают от случайных ударов внутри ящиков. Посмотрите, может, вам тоже подойдет.

Какой SSD? Производитель? Модель? Версия прошивки контроллера?

Выполняли оптимизацию файловой системы (noatime, nodiratime), ядра (swappiness, vm.vfs_cache_pressure), I/O sheduler'a, наподобие этого?