Вопрос решён :) 
Если у кого возникнет аналогичная проблема 
Необходимо зайти в диспетчер устройств, нажать на "устройство обработки изображений"  и отключить вашу вебкамеру. 
После чего установить прогу эмулятор веб камеры, я использовал vcam (не реклама) и выбрать область QR кода в Веб версии.  Через эмулятор зайти в Web версию вотсап и все считывает.