Развернуть нужный снапшот а остальные - удалить.
Если снимки ветвятся т.е. на "чистую машину" установили одно приложение, сняли снимок, потом откатились назад, установили другое приложение и снова сняли снимок - автоматическое слияние этих двух снимков невозможно.
Если же на виртуалке просто каждые 3 дня делались снимки для бэкапа - то старые снимки можно удалять - все изменения сольются в "текущее состояние"