В вопросе вы не указали, что именно не работает, но смею предположить, что указаны неправильные ссылки на статичные файлы.
Во-первых, строкой
app.use(express.static(__dirname + '/public/css'));
Вы открываете доступ только к папке
/public/css. Если вы хотите открыть доступ ко всей папке public нужно использовать
app.use(express.static(__dirname + '/public'));
Во-вторых, вы подключаете скрипты и стили без ведущего слеша. Если перейти на внутреннюю страницу сайта, например на /subpath, то браузер будет искать стили в /subpath/css/index.css. Нужно загружать стили и скрипты с ведущим слешем, чтобы они всегда брались из корня:
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="/css/index.css">
