TKing

а бывает так, чтобы на СМС которое сайт разослал
пользователи могли отвечать, вести что-то вроде смс-диалога?

Ваша маленькая команда могла бы поиграть в Scrum / Kanban.

Тут можно найти перечень тулз с фильтрами.

Еще обратите внимание на Redmine, ActiveCollab, Basecamp.