У вас дефолтный конфиг без https, а на одном из сайтов есть https, поэтому при обращении к 443 порту апач отдает вам этот сайт.
Вам нужно дописать в дефолтный конфиг настройки для https, тогда по ip будет открываться все одинаково. Либо сайт с сертификатом перекинуть на отдельный ip, тогда только он будет открываться по https, а остальное нет.
