Stalker_RED

Распарсить iframe, получить айди ролика, получить по API адрес стрима и прокрутить его в собственном плеере. Не уверен что там с рутубом, но с ютубом подобные штуки прокатывают

Ютубовский ролик в plyr: https://jsfiddle.net/Stalk/67kk51aw/
vimeo он тоже умеет.

А отображать что-либо поверх iframe - так себе идея, так как это кликджекинг, который не любят за проблемы с безопасностью.

так не пробовали?

афаик, debug player позволяет инжектить свой код в практически любой ролик.
т.е. теоретически, такой плагин/аддон на базе дебаг флешплеера сделать можно.
но я не слышал, чтобы подобное существовало.

очень зависит от модели флешки. инструкций в гугле полно: раз, два