Если у вас ТОЧНО будет версионирование, тогда /v1/user
Но версию можно передавать и в http headers, если клиент в состоянии это сделать, то так даже визуально проще.
Определите, какой вариант вам проще реализовать, например:
/контроллер/действие/:id
или
/контроллер/:id/действие
