Шта? Докер на микро ВМ? Что там балансировать то? И да, зачем что-то балансировать внутри одной ВМ? Балансировать надо между несколькими. В этом случае можно обернуть в докер пыхочные приложеньки, на отдельной вм поставить nginx без доокера и настроить проксирование.
Имхо, на такой ВМ докер выглядит оверхедом