У вас ответ в ошибке. Нужно в package.json добавить строчку "type": "module", чтобы можно было использовать import, либо в second.js изменить export function ... на

module.exports = {
  commandMem: (message) => { message.channel.send("hello") }
};

А в main js
const { commandMem } = require('./second.js');

youArray.reduce((acc,cur)=>{
return [...acc, {[cur.Alias]: cur.Data}]
}, [])

Пример: https://jsfiddle.net/Lbkthnq5/