А ты случайно префикс для рубрик не устанавливал свой?
Настройки -> Постоянные ссылки -> Префикс для рубрик.
Wordpress такая гавнина не гибкая, что может и обдеться если его родной префикс category пытаются удалить из url.
А обижается он в таком случае перенаправлением на неверный шаблон.