ну твой легаси без пространства имен находится в глобальном пространстве как и PHP функции/классы.
<?php
namespace Next\Gen;
class Foo extends \Old_Bar {
}
где физически расположен код, не особо важно - тот же композер позволяет передать автозагрузчику свои пути:
<?php
$autoloader = require_once(__DIR__.'/vendor/autoload.php');
