Как понять создание дочернего экземпляра типа родителя?

You can also refer below resource
https://www.flowerbrackets.com/inheritance-in-java/

Как передать несколько массивов из метода в метод?

It is cumbersome and ugly. Create a class which returns an object which contain all arrays.

You can also use ArrayList which holds two dimensional arrays with proper index.