Как настроить PHPStorm, чтобы он не видел, чего не надо и подсказывал в Problems: "Undefined function"?

Так ты пытаешься вызвать функцию, которая в другом файле. Шторм как раз ругается из-за того, что НЕ видит ее, а не наоборот. Либо перенеси функцию в файл 01, либо укажи на эту функцию.

Он тебе все верно выдал - попытка вызова функции, которая не объявлена. Если не понимаешь сути сообщения - гугли что такое объявление функции и вызов функции.