Это должно работать. Т.е. суть в том что при клике по элементу body окно закрывается, а при клике по модальному окну дальнейшая передача текущего события родительским элементам прекращается и до body это событие не доходит.
var myBtm = document.getElementById('myBtm');
var modalCont = document.getElementById('modalCont');
myBtm.addEventListener('click' , function (event) {
event.stopPropagation();
modalCont.style.display = 'block';
});
setTimeout(function () {
modalCont.style.display = 'block';
}, 800);
var close = document.getElementById('close');
close.addEventListener('click' , function () {
modalCont.style.display = '';
});
modalCont.addEventListener("click", function(event){
event.stopPropagation();
});
document.body.addEventListener("click", function(){
modalCont.style.display = '';
});