Дмитрий Мельников

Пользуйтесь Comodo
Cleaning Essentials и KillSwitch, они как раз предназначены для анализа и идентификации скрытых системных процессов. Первая специализируется на поиске вирусов и руткитов, очистке системы, вторая улучшенный аналог Диспечера задач, не только отображает сетевую активность и все процессы в виде древа, но и сверяет все активные по электронной подписи, подсвечивая подозрительные. Ещё там есть Autorun Analyzer, он покажет все процессы и службы в автозапуске. Плюс хорошая мысль добавить отдельно VirusTotal Uploader, чтобы проверять всё подозрительные файлы более чем 50 известными антивирусами, чтоб наверняка.

Для начала нужно научиться обнаруживать стандартные процессы - знать что из них что делает, к чему относится, как себя ведет и как должен запускаться.

После этого уже можно искать нестандартные процессы.

Способы конечно есть, но объяснять их - значит научить человека администрированию windows на достаточно глубоком уровне. Это нельзя вместить в ответ на вопрос, а грубо говоря целый процесс обучения.