Для программатора неважно в каком корпусе находится микроконтроллер. Каждый программатор поддерживает свой список микроконтроллеров.
Для ваших целей отлично подойдет usbasp программатор (или подобный), его можно купить практически в любом (онлайн) магазине радиодеталей или даже сделать самому.
Предложения на eBay.
Сделай Сам.