Я бы не переводил в контрастно черно-белое, а использовал бы greyscale. При любом сечении такой кривой получится кривая с горбиками. Выбираем порог высоты горбика, который учитывается и довольно легко получим количество.
Еще стоит поиграться с каналами, возможно один из каналов будет иметь стабильно больший контраст, чем другие (например, канал насыщенности). Тогда можно даже не переводить в черно-белое, а работать просто с каналом.
Так же необходимо провести диаметры под разными углами, считать значения и усреднять показатели.
