Я всегда префиксы ставил, что в винде, что в линуксе, тупо знак _ в самом начале и всё, нужная папка помечена и всегда будет первой в списке. Ну а если хочется именно скобки, то юзай круглые, все ОС на них нормально реагируют.
_COOL
_COOL_
_(COOL)_
(COOL)
И т.д.
Таких папок, как правило, много не бывает, так что не запутаешься)