В случае AMD они ещё лет 5 назад открыли свои сырцы, примерно пол-года года назад драйвера под AMD стали полностью опенсорсными (т.е. заявили, что проприетарные больше не поддерживаются). В случае с нвидией всё наоборот: Примерно так же, к концу 2010го у них было всё отлично и никаких нареканий не было, но потом они забили на всё это дело, сырцы (это же нвидия) никому не отдавали и примерно пол года назад спохватились (Не просто же так появился этот знаменитый жест Линуса "Nvidia - f**ck u").
Так что в большинстве случаев поддержка современных AMD на линуксах на порядки лучше, если же видео старое, то наоборот - нвидия вне конкуренции.
Подытоживая: Дискретное видео на порядок мощнее, а т.к. видео старое - имеет смысл использовать проприетарные драйвера (т.е. старые от самой AMD), как я уже озвучил выше - они поставляются пока что в двух вариантах (старый от AMD и новый опенсорсный). Обновляться на карточку Nvidia в 2017ом году - крайне спорно, так как их политика такова, что они любят всё закрытое и вкладываются в сообщество (особенно открывая внутренние разработки, ака драйвера) только в крайних случаях.
