Из книг, я бы для начала посоветовал почитать
www.amazon.com/Linux-System-Administration-Handboo... . В остальном, вы и так найдете не мало литературы по линуксу...
Но прежде чем браться за книгу вам надо с начала определиться с дистрибутивом и установить его.
(я не особо вам советую смотреть, но если время есть то можете https://academy.yandex.ru/events/kit/5/)
И самое главное определитесь для чего вам нужна эта ОС, и какой подход вам нужен.
С низу вверх: Gentoo или Arch Linux
С верху вниз: Debian или Slackware & etc.
Ubuntu или Mint, и подобные не советовал бы. Т.к. это готовые пакеты и не факт что вам потом захочется что-то изучать не имея "проблем".
P.S. всё вышесказанное IMHO.
