Если честно не понял вашу проблему, вроде бы всё наглядно видно, и в чем именно проблема не понятна.
$array[0][2] - где $array это ваш трансформированный массив, [0] это ваш id, [2] это ваш count
Чтобы построить таблицу достаточно пройти циклом по вашему массиву.