У Jira 2 версии: серверная, которую ставит чаще всего админ (хотя ничего сложного там нет) , и облачная - по подписке оформляется любым, кто в организации заведует бюджетом.
Вангую, что "кастрированная" — это скорее всего облачная, хотя может и ненастроенная серверная просто.
Первоначальную настройку обычно проводит всё тот же админ, а дальше - находится инициативный некто, кто собирает запросы с команд и пилит схемы экранов и workflow, цепляет pre- и post- триггеры, интегрируется с репозиториями, Slack-ами и прочими сторонними службами.
В своей ПМ-ской практике пришлось освоить полный цикл (не то, чтобы это было офигенно сложно, но людей, которые это умеют/хотят делать и делают хорошо не так много, а работу команд мне нужно было организовывать многократно).