Разобрался, подключил другой простой кулер от проца с характеристикам 12V 0.28A. Он спокойно работает от 1,5 до 12V, то что нужно. И он вообще 4-пиновый.
Почему первый не завёлся — загадка..
Действительно оказалась проблема в клаве. Шлейф в неё вделан намертво, поэтому решил проблему заменой клавиатуры. Пришлось повозиться, т.к. клавиатура держалась на пластиковых заклепках..