Если у вас лежит на сайте установщик, то сделайте
с помощью 7z или другого архиватора обёртку для запуска вашего установщика. То есть сперва будет распаковываться sfx и после распаковки автоматически запускать ваш запакованный setup.exe.
В самом интерфейса SFX-архива, который показывается во время распаковки, можно поместить сообщение о ложных срабатываниях антивирусов, и чтоб пользователи не пугались.
Если-же на сайте лежит не установщик, а программа, которой оный не нужен, то просто запакуйте в SFX c добавлением сообщения в интерфейс SFX-распаковщика о ложных срабатываниях.
