Привет!
cli - это интерфейс командной строки. Т.е. вместе с пакетом устанавливается интерфейс для взаимодействия с пакетом через консоль.
Так, например, выполнив команду на твоем скриншоте, можно будет обратиться к пакету pug
$ pug --help
Иначе устанавливается только пакет, без интерфейса взаимодействия. Что позволяет использовать его в коде, но не через консоль.